Como todos sabem o rocket.chat o roda em background após ser minimizado ou fechado ocasionando assim não notifica os atalhos fixados na barra do menu iniciar.

Para amenizar o problema:

• Na Barra do menu iniciar clicar com botão direito e após Configurações da Barra de tarefas

• Clicar em Barra de Tarefas

• Rolar até "Área de notificação" e clicar para selecionar os icones
  
• Enconte e ative o Rocket.Chat 

Sempre que tiver mensagem não lida o será indicada próximo ao relógio, independente de esta com o programa aberto ou fechado